Olivier's adventures in Wonderland - Student life

Je suis...

Olivier Tilloy — Sat, 02 Sep 2006 18:58:58 +0000

...ingénieur informaticien.

Je n'ai pas encore le diplôme en main, mais c'est tout comme.

Hier ont eu lieu les présentations et démonstrations de notre travail de recherche de cette année en présence de nos superviseurs et d'un chercheur professeur à l'IIE. Les présentations avaient pour but de donner un aperçu du travail réalisé pendant l'année, d'en mettre en avant les points forts, et d'évaluer nos capacités oratoires dans la langue de Shakespeare. La matinée a donc été consacrée à nos trois présentations, une vingtaine de minutes chacun avec le soutien d'un vidéo-projecteur, suivies d'une séance plus ou moins longue de questions de la part des différents spectateurs.

L'après-midi a, lui, été consacré aux démonstrations des applications logicielles que nous avons développé pour illustrer notre recherche. Une petite demi-heure chacun en comptant les questions (et les réponses), et ensuite a commencé la délibération entre superviseurs pour déterminer nos notes, avant de nous convoquer pour nous communiquer leurs observations et les résultats.

Les résultats, pas vraiment inattendus, c'est que Florian, Guillaume et moi validons sans problèmes notre année, et par là même sommes presque officiellement diplômés ingénieurs IIE, l'ultime condition étant de ne pas oublier de soumettre nos thèses fin septembre.

La note finale est composée de trois éléments pondérés par des coefficients, voici les observations qui m'ont été faites :

Présentation (coefficient 9) : malgré le fait que je ne sois pas naturellement un harangueur de foules, ma présentation était bien structurée et convaincante, ma maîtrise de l'anglais me permettant d'exprimer des idées complexes de manière intelligible. Ils ont regretté que je n'aie pas développé plus certains points (parce qu'il y avait matière à), et mes réponses à leurs questions les ont satisfait. Ce qui me vaut une note de 16;
Rapport (coefficient 5) : là aussi ils ont apprécié la qualité de mon anglais, en remarquant au passage que j'ai tendance à écrire des phrases dont on ne voit plus la tête quand on arrive aux pieds, ce qui parfois nuit à la concision. Ma thèse aurait gagné à avoir plus d'illustrations, mais la structure leur a plu, ma façon de présenter d'abord les hypothèses et ensuite de développer les solutions proposées étant, selon leurs mots, audacieuse. Par dessus tout ils ont beaucoup aimé l'emploi de justifications mathématiques avec des jolies formules, même lorsque celles-ci étaient triviales. Encore un 16;
Travail effectué (coefficient 30) : le gros morceau, ce qui est bien normal puisque la note reflète la satisfaction qu'ils ont quant à notre façon d'aborder et d'organiser notre travail sur un an. Satisfaction générale, je suis quelqu'un qui travaille bien indépendamment, j'ai démontré que je suis capable d'utiliser et d'assembler tous les composants logiciels nécessaires afin d'arriver au résultat attendu, j'ai eu une façon très "développement logiciel" d'aborder mon projet. Le sous-entendu direct est que je suis définitivement plus un ingénieur qu'un chercheur, mais ça tombe bien, j'étais déjà au courant. Et hop, un 16 de plus.

Note finale, euh... trois fois sept, trente-six, moins cinq, vingt-sept, je pose tout, je retiens rien... ça fait 16 (il me fallait un 12 pour l'avoir, ce diplôme).

Les observations collectives, quant à elles, sont aussi élogieuses. Ils ont apprécié notre collaboration mutuelle (même si d'un point de vue personnel, je dirais sans hésitation que Guillaume et Florian m'ont beaucoup plus appris que je n'ai pu leur apporter), et de manière générale, nous sommes le meilleur groupe d'étudiants français qu'ils aient eu jusque là. Eloge flatteur, mais loin d'être déplaisant.

Me voilà maintenant officieusement en vacances. Officieusement, parce qu'officiellement il me reste encore quelques corrections à apporter à ma thèse avant de la soumettre pour cette fois-ci avoir le deuxième diplôme, le Master anglais.

Pour les curieux, voici le support de ma présentation :

MSc Final presentation (format PDF, 4.8 Mo)
MSc Final presentation (format ODP, 2.2 Mo)

Je rassemblerai bientôt dans un billet mes impressions personnelles et conclusions sur cette année à Hull. Stay tuned!

Draft Thesis

Olivier Tilloy — Sat, 26 Aug 2006 22:12:19 +0000

Une étape importante de plus dans mon master à Hull : hier j'ai soumis une première version de ma thèse (draft thesis) à mon superviseur qui l'a faite suivre à l'IIE pour évaluation.

En effet, la date limite de soumission officielle de ma thèse est le 30 septembre, et c'est donc ce jour-là que j'aurai terminé mon master. Cette thèse que je soumettrai le 30 septembre sera examinée par des spécialistes du corps académique qui détermineront si mon travail mérite qu'on me décerne un MSc. Pour ce qui est du partenariat entre l'Université de Hull et l'IIE, je serai évalué sur cette draft thesis et sur une présentation orale en présence d'un professeur de l'IIE, cette évaluation déterminant si je mérite mon diplôme d'ingénieur. Plutôt important donc...

Le document que j'ai soumis a beau être un brouillon, il n'en est pas moins complet et dans une version proche de ce qu'il devrait être au final : les seuls changements seront des corrections demandées par mon superviseur.

Pour ceux qui sont intéressés, voici le document :

MSc Draft Thesis (format PDF, 1.3 Mo)

La prochaine étape importante, c'est cette présentation orale, en anglais bien sûr, qui aura lieu vendredi prochain. 25 minutes pour présenter mon travail et expliquer en quoi il est original, suivies des questions des examinateurs et d'une démonstration de l'application que j'ai développée.

Mid-Year Report

Olivier Tilloy — Wed, 15 Mar 2006 23:29:13 +0000

Cette semaine a vu une étape importante de mon Master ici à Hull. J'ai rendu un document intitulé MSc Technical Report, nom de code MYR.

Ce document est en fait un brouillon de thèse, il comprend quatre des huit chapitres qui composeront ma thèse, des conclusions partielles et un plan d'attaque pour le reste de l'année. Il est assez touffu (55 pages) et pourrait sûrement être élagué, mais il semble qu'écrire des tartines plaise beaucoup à mon superviseur, surtout quand il y a des jolies formules mathématiques qu'il ne cherche même pas à comprendre.

Pour ceux qui sont intéressés, voici la version finale :

MSc Technical Report (format PDF, 470 Ko)

Un grand merci à tous mes relecteurs : Marie, Una, Kaleo et Guij.

Calibration

Olivier Tilloy — Tue, 15 Nov 2005 19:08:04 +0000

Aujourd'hui j'ai commencé la partie technique de mon projet. Enfin disons que j'ai commencé la phase de "Familiarisation avec les outils". J'apprends en quelque sorte à planter un clou avec le marteau ultra-sophistiqué qu'on me confie.

J'ai d'abord compilé la librairie H3D, que je vais utiliser pour la gestion du graphisme 3D et de la partie haptique. Je ne m'étendrai pas sur le fait que nous n'avons pas le droit d'installer les outils nécessaires nous-mêmes et que j'ai dû attendre 3 jours avant d'avoir une version du compilateur qui fonctionne, il semblerait que dans ce labo, tout comme dans les entreprises où j'ai eu l'occasion de faire des stages, on ne fait pas par défaut confiance aux utilisateurs. Enfin ça vaut mieux ils risqueraient de tout casser...

Une fois le tout compilé et fonctionnel, il s'agissait de calibrer la bête. La partie la moins amusante. En effet, en exécutant les démos fournies avec la librairie, le rendu graphique était bon, mais le rendu haptique, lui, était plutôt chaotique...

J'ai donc eu le plaisir (?) de me replonger dans les matrices de coordonnées homogènes, mises à l'échelle, rotations et translations... Et après quelques heures de tests sur mon nouvel ami Berk (ci-dessous en photo), le résultat est plutôt satisfaisant.

Demain je m'attaque à un calibrage plus fin!

Project Topic Analysis

Olivier Tilloy — Mon, 07 Nov 2005 21:12:16 +0000

Aujourd'hui était la deadline pour rendre le premier document important de ma production de cette année de recherche : le Project Topic Analysis, autrement dit une analyse détaillée du sujet de recherche qui va, espérons-le, me motiver durant toute l'année, étoffée par une étude de l'état des connaissances actuelles en la matière ainsi que de mes prévisions concernant le comment et le quand de mon programme de recherche.

Le résultat est un document de 10 pages dont le titre est Medical Image Segmentation using Immersive Visualization. Pour ceux qui sont intéressés, voici la version finale¹ :

Project Topic Analysis (format PDF, 212 Ko)

Mon sujet de recherche, enfin clairement identifié, a pas mal évolué depuis ce que j'écrivais dans cet article. L'hypothèse de travail est (je me cite) :

The hypothesis of this MSc research work is the suitability of the use of an immersive environment to improve (both in terms of accuracy, speed and user experience) classic 2D slice-based image segmentation techniques.

Ce qui peut se traduire par : "L'hypothèse étudiée dans ce travail de recherche de Mastère est l'adéquation de l'utilisation d'un environnement immersif pour améliorer (en termes de précision, de vitesse et d'ergonomie pour l'utilisateur) les techniques classiques de segmentation de tranches d'images en 2D."

Je rendrai compte régulièrement sur ce blog de l'état d'avancement de mon travail de recherche, en essayant d'être clair et intéressant. Stay connected!

[1] : Merci beaucoup à Marie pour la relecture attentive qui m'a permis de corriger quelques (grosses) fautes d'orthographe!

Le petit Olivier en thèse

Olivier Tilloy — Wed, 26 Oct 2005 00:36:50 +0000

Avertissement

On nous a souvent demandé ce que nous faisions comme travail de recherche. Malgré tous nos efforts pour rester vagues et un peu compréhensibles, nos parents, nos amis répliquaient invariablement à nos explications : "oui, oui..." en soupirant plus ou moins, plus intrigués que jamais. Aussi nous sommes-nous résignés à raconter aux masses étonnées non pas notre travail, mais ce qu'est la vie du thésard. Il semblerait que nous ayons réussi, à en croire les premières réactions.

Le petit Nicolas en thèse

Le Directeur de Thèse

Pour commencer une thèse, il faut avoir un patron. Un patron, c'est un monsieur très, très fort qui me pose un problème et qui va m'aider à le résoudre. Là, c'est mon patron photographié par Christian Mercatier-Bresson.

La Recherche

Au début, c'est tellement compliqué, on n'y comprend rien.

On peut passer des heures et des heures à chercher sans rien trouver. Dans ces moments-là, mon papa et ma maman sont drôlement inquiets et quand ma maman demande si c'était une bonne idée de faire faire une thèse au petit (c'est moi), mon papa ouvre la bouche sans parler, il agite les bras, et il s'en va lire le journal dans le salon.

La Découverte

Des fois, c'est super, parce que je découvre des trucs que mon patron m'avait demandés. Evidemment, ça peut arriver à n'importe quelle heure, et mes parents ne sont pas toujours ravis.

Ils se demandent si je ne deviens pas complètement fou, mais ma maman sait que mon papa n'aime pas qu'elle le lui dise.

Moi, je trouve ça plutôt normal d'être content. D'ailleurs, quand mon patron trouve un théorème, il est super fier et ses copains (qui sont aussi des gens très, très forts) sont super contents de lui. Mais ça mes parents, ils ne le savent pas.

Des fois aussi, ça se passe mal, parce que je me trompe. Et quand je me trompe, avec mon patron, ça ne rigole pas, mais alors pas du tout. "Regardez-moi dans les yeux, Nicolas", il me dit, pas content du tout. "Vous appelez ça du travail, peut-être ?" qu'il me demande. Eh ben, là, ça a l'air d'une question, mais il ne faut surtout pas répondre, parce que sinon, il se fâche tout rouge!

Les Séminaires

De temps en temps, un monsieur très, très important et vachement fort (mais pas aussi fort que mon patron, quand même) vient nous parler de trucs super-compliqués. ça s'appelle un séminaire, et pendant un séminaire, ça ne rigole pas non plus. Quand le monsieur a fini de parler, mon patron lui pose des tas de questions très compliquées, et il ne sait pas toujours répondre. Et là c'est pas juste, parce que lui, il ne se fait pas disputer!

La Soutenance

Quand j'aurai fini, il y aura une grande cérémonie avec plein de gens très, très forts (il y aura même d'autres patrons, c'est dire) et il y aura un vieux monsieur très, très important qui me dira que c'est très bien, mon petit, les chemins de la Recherche me sont glorieusement ouverts et je suis l'honneur de mes parents et l'orgueil de mon pays, et tout le baratin. Et après, il y aura un super goûter avec tous mes amis. Génial!

Et quand il lira tout cela dans le journal, mon papa sera très fier et ma maman sera tellement contente qu'elle me servira deux fois de la crème renversée, mon dessert préféré. C'est vraiment super, une thèse, à la fin!

La Gloire

D'ailleurs les filles, ça les impressionne drôlement de savoir qu'on a fait une thèse de mathématiques et qu'on a trouvé des tas de théorèmes compliqués et tout, et tout. Même la maman de Marie-Edwige, elle me fait des grands sourires maintenant, alors qu'elle trouvait que j'étais un petit garçon très turbulent.

Dessins : J.J. Sempé
Formules : Y. Bugeaud - M. Mignotte - F. Normandin
Texte : G. Taviot
Mise en page : G. Taviot, A. Maes

Mis à part que je ne fais pas une thèse de doctorat mais de mastère, je trouve que cette sympathique description de la vie d'un thésard par Arnaud Maes résume assez bien mon boulot :)

Postgraduate Induction Workshop

Olivier Tilloy — Sun, 16 Oct 2005 14:21:10 +0000

Vendredi a eu lieu le "Postgraduate Induction Workshop", organisé par Professor Phillips, directeur de recherche pour les postgraduates, et accessoirement mon superviseur. Il s'agissait de présenter différents aspects du travail de recherche (en informatique bien sûr) et de nous donner des conseils. Le programme de la journée était, disons... pas violent :

11.30 - 12.30 : Session 1
Postgraduate Research in Computer Science
Supervisory Panel Procedures
Personal Development Plans
Post Graduate Training
12.30 - 13.30 : Lunch
13.30 - 14.30 : Session 2
Writing a Thesis
Intellectual Property
Postgraduate Representation
14.40 - 15.00 : Coffee
15.00 - 16.15 : Session 3
PhD Research Question Time
Concluding Remarks

Les deux principaux événements de la journée étaient probablement le déjeuner et le café :)

Tout ceci mis à part, les interventions/discussions étaient plutôt intéressantes. En fait il s'agissait principalement de présenter un certain nombre de composantes de la recherche informatique aux étudiants nouveaux dans le département, et particulièrement aux doctorants (les PhD students). En effet la plupart des présentations étaient clairement destinées aux PhD, ce qui est plutôt normal étant donné que sur une trentaine d'étudiants répartis dans les différents laboratoires, il n'y a à ma connaissance que 4 MSc (dont nous trois de l'IIE). Pour un laboratoire de recherche, un MSc n'est (en général) intéressant que dans la mesure où il est potentiellement un futur PhD : là où un MSc apprend à faire de la recherche et amasse une certaine quantité de connaissances sur un sujet précis, un PhD est censé faire avancer l'état de l'art dans le domaine auquel il s'intéresse, c'est-à-dire contribuer à la connaissance commune en publiant des résultats novateurs. Il y a cependant des exceptions, des MSc qui arrivent eux aussi à développer des concepts/applications vraiment novateurs.

La plupart de ce qui a été dit ne nous concernait donc pas directement, et à ce titre certaines sessions étaient vraiment longues (et puis à ne pas avoir de cours du tout, on perd l'habitude d'écouter passivement des gens parler pendant plus d'une demi-heure). En revanche cette journée m'aura permis d'avoir un bon aperçu de ce que peut-être un doctorat, et plus ou moins confirmé dans l'idée que : un doctorat après mon master, pourquoi pas, mais uniquement si les conditions (financement principalement) sont bonnes et surtout, surtout, il faudra que le sujet de recherche me passionne. Je ne suis pas prêt à prendre la première proposition venue dans n'importe quel domaine de l'informatique si c'est juste pour rajouter un titre de docteur sur mon CV (ça en jetterait quand même!). Affaire à suivre...

Et l'autre point très positif de cette journée, c'est évidemment d'avoir passé une bonne partie du temps à écouter des gens parler anglais (et la plupart du temps à les comprendre, ce qui n'était pas forcément évident pour certains...), et d'avoir pu (un peu) discuter avec certaines personnes du labo. Même si je commence à me sentir à l'aise en conversation, il y a encore (beaucoup) de boulot avant de vraiment maîtriser la langue!

Un chercheur sachant chercher...

Olivier Tilloy — Fri, 30 Sep 2005 19:34:14 +0000

Voici un article qui devrait rassurer les gens qui pensent que je suis en pleine année sabbatique (quoique ça ne me déplairait pas...).

Et oui, je suis venu à Hull pour... travailler! Etonnant, non? Mais faire quoi au juste? Dans le cadre de ma troisième année d'école d'ingénieur, il existe un partenariat entre l'IIE et le département informatique de l'Université de Hull qui permet chaque année à trois élèves de l'IIE de venir faire de la recherche à Hull et ainsi d'obtenir un double diplôme : le diplôme d'ingénieur bien sûr, et un Master of Science by research de l'Université de Hull (rien que ça!). Outre le fait que ça me permet de passer une année le plus loin d'Evry possible (jamais deux sans trois, c'est pas pour moi!), c'est une expérience enrichissante sur bien des plans : informatique évidemment, linguistique, et surtout culturel. Comme je l'ai dit précedemment, je suis sur un campus de 18000 étudiants dont 2000 étrangers!

Le département informatique de l'Université de Hull est surtout réputé pour son laboratoire de Simulation et Visualisation, plus spécifiquement pour son environnement immersif de réalité virtuel tout nouveau, le HIVE, une grande salle équipée de joujoux high-tech pour faire de la réalité virtuelle à grande échelle. Et ça tombe bien, c'est justement dans ce laboratoire que je vais passer un an.

Au labo de SimVis, on peut trouver des OVNI comme ça...

...ou bien encore comme ça (ceci est un écran parabole
qui permet d'immerger l'utilisateur dans un monde 3D).

Concrètement, je vais travailler sur la segmentation d'images et les possibles applications dans un environnement virtuel avec réponse haptique. Ahaha, ça vous avance bien tout ça, hein? Bon d'accord j'explique, mais attention prenez des notes je répéterai pas! La segmentation d'images, c'est le procédé qui consiste à retrouver de manière algorithmique les contours d'une image afin de déterminer des zones. Le premier exemple pratique qui me vient à l'esprit, c'est retrouver les contours d'un organe sur une image prise par IRM, et toutes les applications que ça peut avoir dans le domaine médical. Il existe des algorithmes qui font ça plus ou moins bien selon la qualité de l'image, mais en règle générale après il faut toujours une intervention humaine pour affiner le résultat. Et moi, en gros je vais voir si on ne peut pas faire la même chose en 3D (sur une image en volume) avec une réponse haptique. Kézako?

L'haptique c'est la science qui consiste à reproduire de manière mécanique les sensations de toucher (formes, surfaces, résistance, texture...) pour compléter le rendu visuel et sonore d'un environnement virtuel. Le plus basique des équipements haptiques c'est probablement le volant à retour de force (en une seule dimension), puis on trouve des joysticks à retour de force (en 2D, les principales applications étant les jeux), et enfin on passe aux choses sérieuses avec les équipements qui offrent des sensations en 3 dimensions, avec 3 ou 6 degrés de liberté. La machine sur laquelle je vais travailler est un Phantom à 6 degrés de liberté, monté sur une machine appelée Reachin Device qui permet de visualiser les objets en 3D à l'endroit où on les sent, à l'aide de lunettes de vision 3D.

Le Reachin Device, combinaison d'un Phantom à 6 degrés de liberté
avec un écran qui projette une image stéréo visible avec des lunettes 3D,
et un miroir permettant de localiser les objets au même endroit
pour les yeux et les mains!

Tout ça donc pour travailler sur la "sculpture" de volumes représentant les frontières d'organes obtenues par segmentation d'image et permettre d'affiner les résultats automatiques. La réponse haptique pourrait permettre de ressentir le volume pour rendre la retouche intuitive, et/ou guider l'utilisateur dans ses mouvements.

Le stylet haptique du Phantom, devinez à qui
appartient la main dessus...

Si après ça on dit que je ne travaille pas...